学術論文 

Evaluating the effects of filtration volume and filter pore size on detection of fish environmental DNA using metabarcoding for practical use in the open ocean. 

2023 Ecology and Evolution, 13, e9921. DOI: 10.1002/ece3.9921 

Kawakami T, Yamazaki A, Asami M, Gotoh Y, Yamanaka H, Hyodo S, Ueno H, and Kasai A 


Inshore migration of Japanese eel Anguilla japonica encouraged by active horizontal swimming during the glass eel stage. 

2023 Fisheries Oceanography, in press. DOI: 10.1111/fog.12637 

Karaki T, Sakamoto K, Yamanaka G, Kimura S, and Kasai A 

 

Atmosphere–sea ice–ocean interaction study in Saroma-ko Lagoon, Hokkaido, Japan 2021 

2022. Bulletin of Glaciological Research, 40, 1-17. DOI: 10.5331/bgr.21R02 

Nomura D, Ikawa H, Kawaguchi Y, Kanna N, Kawakami T, Nosaka Y, Umezawa S, Tozawa M, Horikawa T, Sahashi R, Noshiro T, Kaba I, Ozaki M, Kondo F, Ono K, YABE IS, Yae Son E, Toyoda T, Kameyama S, Wang C, Obata H, Ooki A, Ueno H, and Kasai A 


Otolith isotopic characterization as a nursery habitat indicator for stone flounder Platichthys bicoloratus 

2022. Estuarine Coastal and Shelf Sciences, DOI: 10.1016/j.ecss.2022.108028 

Amano Y, Otake T, Togashi H, Wada T, Kasai A, Kato Y, Yoshizumi C, Tayasu I, Kurita Y, and Shirai K 

Watershed proportion of forest cover fostering the conservation of red-listed fish richness in estuaries

2021. Conservation Biology, in press.
Lavergne E, Kume M, Ahn H, Henmi Y, Terashima Y, Ye F, Kameyama S, Kai Y, Kadowaki K, Yamashita Y, and Kasai A 


Intraspecific genetic variability and diurnal activity affect environmental DNA detection in Japanese eel
2021. PLOSONE, DOI:  10.1371/journal.pone.0231718
Takahashi S, Takada S, Yamanaka H, Masuda R and Kasai A

Distribution of Japanese eel Anguilla japonica revealed by environmental DNA
2021. Frontiers Ecology and Revolution, DOI: 10.3389/fevo.2021.621461 

Kasai A, Yamazaki A, Ahn H, Yamanaka H, Kameyama S, Masuda R, Azuma N, Kimura S, Karaki T, Kurokawa Y and Yamashita Y

Factors structuring estuarine and coastal fish communities across Japan using environmental DNA metabarcoding

2021. Ecological Indicators, DOI: 10.1016/j.ecolind.2020.107216

Kume M, Lavergne E, Ahn H, Terashima Y, Kadowaki K, Ye F, Kameyama S, Kai Y, Henmi Y, Yamashita Y and Kasai A 


Traditional land use effects on nutrient export from watersheds to coastal seas
2020. Nutrient Cycling in Agroecosystems, DOI: 10.1007/s10705-020-10102-9
Sugimoto R, Kasai A, Tait DR, Rihei T, Hirai T, Asai K, Tamura Y and Yamashita Y

Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA and hydrodynamic modelling
2020. Molecular Ecology, DOI: 10.1111/mec.15530
Fukaya K, Murakami H, Yoon S, Minami K, Osada Y, Yamamoto S, Masuda R, Kasai A, Miyashita K, Minamoto T and Kondoh M

An illustrated manual for environmental DNA research: Water sampling guidelines and experimental protocols
2020. Environmental DNA, DOI: 10.1002/edn3.121
Minamoto T, Miya M, Sado T, Seino S, Doi H, Kondoh M, Nakamura K, Takahara T, Yamamoto S, Yamanaka H, Araki H, Iwasaki W, Kasai A, Masuda R and Uchii K

Evaluation of biodiversity of five estuaries in Japan using environmental DNA metabarcoding method
2020. PLOSONE, DOI: 10.1371/journal.pone.0231127
Ahn H, Kume M, Terashima Y, Ye F, Kameyama S, Miya M, Yamashita Y and Kasai A

The effect of temperature on environmental DNA degradation of Japanese eel 

2020. Fisheries Science, 86, 465-471. DOI: 10.1007/s12562-020-01409-1

Kasai A, Takada S, Yamazaki A, Masuda R and Yamanaka H


Quantitative estimation of the ecosystem services supporting the growth of Japanese chum salmon

2020. Deep Sea Research Part II, DOI: 10.1016/j.dsr2.2019.104702

Karasawa Y, Ueno H, Tanisugi R, Dobashi R, Yoon S, Kasai A and Kiyota M 

Winter monsoon promotes the transport of Japanese temperate bass Lateolabrax japonicus eggs and larvae toward the innermost part of Tango Bay, the Sea of Japan

2020. Fisheries Oceanography, 29, 66-83. DOI: 10.1111/fog.12450

Suzuki K, Fuji T, Kasai A, Itoh S, Kimura S and Yamashita Y 

Correlation of changes in seasonal distribution and catch of red sea bream Pagrus major with winter temperature in the eastern Seto Inland Sea, Japan (1972-2010)

2020. Fisheries Oceanography, 29, 1-9. DOI: 10.1111/fog.12432

Yamamoto M, Omi H, Yasue N and Kasai A

Dispersion and degradation of environmental DNA from caged fish in a marine environment

2019. Fisheries Science, 85, 327-337. DOI: 10.1007/s12562-018-1282-6

Murakami H, Yoon S, Kasai A, Minamoto T, Yamamoto S, Sakata MK, Horiuchi T, Sawada H, Kondoh M, Yamashita Y and Masuda R 


Age determination and growth pattern of temperate seabass Lateolabrax japonicus in Tango Bay and Sendai Bay, Japan

2019. Fisheries Science, 85, 81-98.DOI: 10.1007/s12562-018-1271-9

Jiang W, Lavergne E, Kurita Y, Todate K, Kasai A, Fuji T and Yamashita Y

Modeling the coastal ecosystem complex: present state and challenges

2018. Fisheries Science, 84, 293-307. DOI: 10.1007/s12562-018-1181-x

Itoh S, Takeshige A, Kasai A and Kimura S

Upstream migration mechanisms of juvenile temperate seabass Lateolabrax japonicus in the stratified Yura River estuary

2018. Fisheries Science, 84, 163-172. DOI: 10.1007/s12562-017-1167-0

Fuji T, Kasai A and Yamashita Y


Partial migration of juvenile temperate seabass Lateolabrax japonicus: a versatile survival strategy

2018. Fisheries Science, 84, 153-162. DOI: 10.1007/s12562-017-1166-1

Kasai A, Fuji T, Suzuki KW and Yamashita Y


大分県国東半島宇佐地域におけるウナギ石倉漁とその生態学的役割

2018. 水産学会誌, 84(1), 45-53. jstage

原田真実・久米学・望岡典隆・田村勇司・神崎東子・橋口峻也・笠井亮秀・山下洋


Food composition for blue mussels (Mytilus edulis) in the Menai Strait, UK, based on physical and biochemical analyses 

2017. Journal of Shellfish Research, 36, 659-668. DOI: 10.2983/035.036.0315

Morioka H, Kasai A, Miyake Y, Kitagawa T and Kimura S

Relative contributions of external forcing factors to circulation and hydrographic properties in a micro-tidal estuary

2017. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 198, 225-235. DOI: 10.1016/j.ecss.2017.09.017

Yoon S and Kasai A

Estuarine circulation-driven entrainment of oceanic nutrients fuels coastal phytoplankton in an open coastal system in Japan

2017. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 184, 126-137. DOI: 10.1016/j.ecss.2016.10.031

Watanabe K, Kasai A, Fukuzaki K, Ueno M and Yamashita Y 

Dynamics of iron in the Chikugo River Basin: Comparison of iron with nitrogen and phosphate input to the estuary

2016. Regional Studies in Marine Sciences, 8, 89-98. DOI: 10.1016/j.rsma.2016.09.007

Yamamoto M, Liu D, Kasai A, Okubo K and Tanaka M

Circulation and haline structure of a microtidal bay in the Sea of Japan influenced by the winter monsoon and the Tsushima Warm Current 

2016. Journal of Geophysical Research. DOI: 10.1002/2015JC011441.

Itoh S, Kasai A, Takeshige A, Zenimoto K, Kimura S, Suzuki K, Miyake Y, Funahashi T, Yamashita Y and Watabane Y

Relative contribution of estuarine nursery areas to the adult population of the temperate seabass Lateolabrax japonicus in the Tango Sea, as revealed by otolith Sr:Ca ratios

2016. Fisheries Oceanography, 25, 448-456. DOI: 10.1111/fog.12164

Fuji T, Kasai A, Ueno M and Yamashita Y

Isotopic trophic-step fractionation of the freshwater clam Corbicula sandai

2016. Fisheries Science, 82, 491-498. DOI: 10.1007/s12562-016-0970-3

Kasai A, Ishizaki D and Isoda T

Key biogeochemical processes evaluated by the stable nitrogen isotopes of dissolved inorganic nitrogen in the Yodo River estuary, Japan

2016. Biogeochemistry, 128, 1–17. DOI: 10.1007/s10533-016-0190-z

Sugimoto R and Kasai A

環境DNAを用いた沿岸域における魚類モニタリング

2016. 沿岸海洋研究,53, 173-178.DOI: 10.32142/engankaiyo.53.2_173

源利文・山本哲史・笠井亮秀・近藤倫生

The importance of estuarine production of large prey for the growth of juvenile temperate seabass (Lateolabrax japonicus)

2016. Estuaries and Coasts, 39, 1208-1220. DOI: 10.1007/s12237-015-0051-3

Fuji T, Kasai A, Ueno M and Yamashita Y

総説

 豊かな沿岸を育む森林の役割 

2022 Ocean News Letter,528, 4-5. 

笠井亮秀 


ニホンウナギの分布域を環境DNA解析で推定 

2021 東アジア鰻学会ニュースレター,17, 1-2. 

笠井亮秀 


ウナギはどこにいる?~環境DNA解析で生物を採らずに分布を調べる~
2021 Ebucheb,82, 2-5.
笠井亮秀

環境DNAを用いた生物多様性の評価と水産資源推定の可能性

2020 JATAFFジャーナル,8(2), 34-39.

笠井亮秀

資源環境・漁場環境

2018日本水産学会85周年記念誌,141-143.

笠井亮秀

流動モデルを用いた環境DNA濃度分布の再現

2018海洋と生物,234, 23-27.

笠井亮秀・尹錫鎭


Atlantisを用いた沿岸域生態系モデルの構築

2016 月刊海洋,48(7),315-320.

竹茂愛吾,伊藤幸彦,笠井亮秀,Yin Shengle,木村伸吾

沿岸域の物質循環と生物生産機構に関する研究

2016 水産海洋研究,80(2), 146-152.

笠井亮秀

講演

環境問題と渡島の海について 

北斗市男女パートナーシップ講演会,2023年2月4日,北斗市総合文化センター「かなで~る」 

笠井亮秀 
 

環境DNA解析 ~外洋域の生物多様性を探る~ 

日本郵船オンライン講演会,2022年12月23日,オンライン開催 

笠井亮秀 
 

気象庁と水産学の接合点 

気象庁談話会,2022年12月14日,函館地方気象台 

笠井亮秀 

ニホンウナギの居場所を探す優れもの:環境DNA 

絶滅危惧種ニホンウナギとともに拓く未来へ, 2022年12月10日, 鎮西学院大学西山ホール 

笠井亮秀

 

北洋研究シンポジウムの50年とこれから 

創立60周年記念シンポジウム 漁業現場と水産海洋研究をつなぐ地域研究集会-地域のホットトピックは何か?, 2022年11月3日, 水産研究・教育機構 横浜庁舎 

笠井亮秀 


環境DNAを用いた新たな生物多様性評価の試み

2020年度水産海洋学会シンポジウム「陸域の人間活動が沿岸域の生態系と漁業資源に与える影響」,2020年11月16日~21日,オンライン開催

笠井亮秀


Environmental DNA metabarcoding as a tool of Biodiversity Assessment
International Biodiversity Conference 2019, November 11-15, 2019, Honey's Hotel, Mati, Philippines
Akihide Kasai 

環境DNA分析によるニホンウナギの分布推定
2019年度環境DNA学会第2回神戸大会,2019年11月4日,神戸大学鶴甲第2キャンパス 
笠井亮秀

環境DNA分析から見たニホンウナギの分布
うな丼の未来シンポジウム,2019年7月8日,東京大学農学部
笠井亮秀 

環境 DNA を用いた海洋生物モニタリングの現状と今後の展望
平成 29 年度東北ブロック底魚研究連絡会議,2018年2月27日,八戸商工会議所
笠井亮秀

沿岸生態系に果たす河川の役割 
高知大学研究拠点プロジェクト 革新的な水・バイオマス循環システムの構築 公開シンポジウム,2017年12月2日,ちより街テラス
笠井亮秀

The effect of land use structure in the catchment area on ecosystems in coastal seas
The JSFS 85th Anniversary-Commemorative International Symposium "Fisheries Science for Future Generations",  22-24 September 2017, Tokyo University of Marine Science and Technology
Akihide Kasai

書籍

いのちの循環「森里海」の現場から,花乱社(福岡),田中克監修・地球環境自然学講座編, 2022.

森と海をつなぐ河口域生態系を探る,114-117.

環境DNA 生態系の真の姿を読み解く,共立出版(東京),土居秀幸・近藤倫生編, 2021.
環境DNAを用いた大規模生態系観測の意義と展望,235-248.

豊かな内水面水産資源の復活のために-宍道湖からの提言,生物研究社(東京),山室真澄編,2020.

ヤマトシジミの好適餌料の推定および数値シミュレーションによるヤマトシジミ浮遊幼生の輸送・生残実験,45-51.

Connectivity of Hills, Humans and Oceans -Challenge to improvement of watershed and coastal environments. Kyoto University Press, Edited by N Shimizu, R Tateno, A Kasai, H Mukai and Y Yamashita.

学会発表

Distribution of Polar cod, Boreogadus saida, in the Chukchi Sea inferred from environmental DNA analysis. 

Seventh International Symposium on Arctic Research, March 6-10, 2023, National Institute of Polar Research 

T. Kawakami, A. Yamazaki, H. Jiang, H. Ueno, and A. Kasai 

 

環境DNAメタバーコーディング解析で読み解く京都府由良川の魚類相の季節変化 

環境DNA学会あなたが主役のワークショップ, 2022年11月19日, オンライン開催 

村上弘章・笹野祥愛・益田玲爾・山下 洋・笠井亮秀 
 

商船を用いた外洋における環境DNAによる魚類群集調査 

2022年度 水産海洋学会創立60周年記念大会, 2022年11月4-6日, 水産研究・教育機構 横浜庁舎 

笠井亮秀・近藤倫生・田辺晶史・川上達也・山川 央・日本郵船グループ 


ファインメッシュモデルを用いた津軽海峡における流動構造の解析 

2022年度 水産海洋学会創立60周年記念大会, 2022年11月4-6日, 水産研究・教育機構 横浜庁舎 

佐藤寛通・唐木達郎・坂本 圭・山中吾郎・高木 力・笠井亮秀 

環境DNAで読み解く河川と沿岸域の魚類多様性とその生態

第68回日本生態学会大会,2021年3月17-21日,オンライン開催
村上弘章・内藤隆慈・志水正敏・益田玲爾・笠井亮秀
 

Substantial seasonal intrusion of marine fish species elucidated by environmental DNA metabarcoding in Yura River, Kyoto 

Tohoku University – OIST 3rd Joint Workshop on Biodiversity: From Genes and Species to Ecosystem Services and Resilience, 2022年10月24-26日, Tohoku University 

Hiroaki Murakami, Sachia Sasano, Reiji Masuda, Yoh Yamashita, and, Akihide Kasai 

 

環境DNAメタバーコーディングによる北極圏における魚類群集構造の解析 

JPGU, 2022年5月29日, Online 

川上哲也・山崎 彩・上野洋路・兵藤 晋・笠井亮秀 

海洋高次捕食者にとって知床周辺海域はどのような場所か?

第69回日本生態学会大会,2022年3月14~19日

三谷曜子・櫻木雄太・古巻史穂・小川 萌日香・山崎 彩・笠井亮秀・西沢文吾・綿貫 豊

 

Detection of fish environmental DNA from under-ice water and sea ice in Saroma-ko Lagoon,Hokkaido, Japan 

第36回北方圏国際シンポジウム オホーツク海と流氷-オンラインイン開催,2022年2月21日~23日 

川上達也・尾崎 誠・山崎 彩・野村大樹・笠井亮秀 

 

環境DNAを用いた夏期知床半島周辺海域における魚類群集の空間分布 

令和4年度日本水産学会春季大会,2022年3月26~30日,オンライン開催 

櫻木雄太・山崎彩・笠井亮秀・三谷曜子 

 

豊かな森林が河口域の生物多様性保全につながる~環境DNAメタバーコーディングによるアプローチ~ 

令和4年度日本水産学会春季大会,2022年3月26~30日,オンライン開催 

Edouard Lavergne・久米学・Hyojin Ahn・邉見由美・寺島佑樹・Feng Ye・亀山哲・甲斐嘉晃・門脇浩明・小林志保・山下洋・笠井亮秀 

環境DNA解析によって推定した分布北限域におけるアユの生活史特性 

令和4年度日本水産学会春季大会,2022年3月26~30日,オンライン開催 

米子拓真・川上達也・笠井亮秀 

瀬戸内海における河川の魚類多様性に与える環境要因と人間活動の影響 

令和4年度日本水産学会春季大会,2022年3月26~30日,オンライン開催 

山崎彩・村上弘章・亀岡大真・山中裕樹・亀山哲・益田玲爾・山下洋・笠井亮秀 


仔魚輸送実験による全国の河川におけるニホンウナギの分布域推定

東アジア鰻学会第4回研究発表会,2021年3月31日,オンライン開催
笠井亮秀・唐木達郎・坂本圭・木村伸吾
 

 黒潮親潮混合域における高気圧性渦の微細構造および一次生産と魚類分布への影響

日本水産学会 2020年度春季大会,2021年3月26日~30日,オンライン開催
土橋稜・上野洋路・加藤陸・閻乃筝・向井徹・安間洋樹・野村大樹・笠井亮秀
 

環境DNA分析に基づく全国の河川におけるニホンウナギの分布
日本水産学会 2020年度春季大会,2021年3月26日~30日,オンライン開催
笠井亮秀・山崎彩・安孝珍・山中裕樹・亀山哲・益田玲爾・東信行・木村伸吾・唐木達郎・黒川優子・山下洋
  

気象庁海洋大循環モデルを用いたニホンウナギの仔魚輸送実験

日本海洋学会 2020年度秋季大会,2020年11月27日~29日,オンライン開催

唐木達郎・坂本圭・木村伸吾・笠井亮秀 


利根川水系とその周辺におけるチャネルキャットフィッシュの分布
環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会,2020年11月14日~16日,オンライン開催
山崎 彩・山中裕樹・伊藤元裕・木村伸吾・笠井亮秀

ニホンウナギの環境DNA放出量に与える遺伝子変異と活動日周性の影響
環境DNA学会第3回大会・第36回個体群生態学会大会合同大会,2020年11月14日~16日,オンライン開催
高橋さやか・髙田真悟・山中裕樹・益田玲爾・笠井亮秀

環境DNA分析によるエスチュアリーにおける魚類の多様性評価

2019年度水産海洋学会,2019年11月8日~10日,東北大学農学部

笠井亮秀・安 孝珍・久米 学・寺島祐樹・Ye Feng・亀山 哲・宮 正樹・山下 洋


環境DNA手法を用いた日本縁辺部におけるニホンウナギの分布可能性の解明

2019年度水産海洋学会,2019年11月8日~10日,東北大学農学部

定行洋亮・笠井亮秀・山下 洋・東 信行・山中裕樹・亀山 哲・久米 学・和田敏裕・木村伸吾

Seasonal changes of fish biodiversity in Hakodate Bay, Japan, revealed by eDNA metabarcoding technique

The fourth Asian marine biology symposium, 4-6 November 2019, National Taiwan University

Hyojin Ahn, Akihide Kasai and Yoh Yamashita


環境DNA分析によるニホンウナギの分布推定

2019年度環境DNA学会第2回神戸大会,2019年11月4日,神戸大学鶴甲第2キャンパス

笠井亮秀


環境DNAを用いた全国31河川河口域における魚類群集構造の解明

2019年度日本魚類学会年会,2019年9月20~23日,高知大学朝倉キャンパス

久米学・安孝珍・寺島佑樹・Edouard Lavergne・Feng Ye・亀山哲・邉見由美・甲斐嘉晃・伊勢武史・笠井亮秀・山下洋


Evaluation of biodiversity at five estuaries in Japan using environmental DNA  metabarcoding method

54th European marine biology symposium, 25 - 29 August 2019, University College Dublin

Hyojin Ahn, Manabu Kume, Yuki Terashima, Feng Ye, Satoshi Kameyama, Masaki Miya, Yoh Yamashita and Akihide Kasai


福島県松川浦と流入河におけるニホンウナギの摂餌生態

平成31年度日本水産学会春季大会,2019年3月26日~30日,東京海洋大学

Alisa Kutzer Alisa Kutzer・小巻拓平・野田 琢嗣・和田敏裕・久米 学・寺島佑樹・堀 友彌・高木淳一・三田村啓理・笠井亮秀・荒井修亮・山下 洋


環境DNAを用いた全国河川のニホンウナギ分布調査 

平成31年度日本水産学会春季大会,2019年3月26日~30日,東京海洋大学

笠井亮秀・高田真悟・山崎 彩・定行洋亮・木村伸吾・安 孝珍・寺島佑樹・久米 学・益田玲爾・山下 洋・山中裕樹・今藤夏子・亀山哲・東 信行

Comparison and integration of different ecosystem models for appropriate use of model characteristics

4th CLIOTOP symposium, 15-19 October 2018, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan

Aigo Takeshige, Shiroh Yonezaki, Sachihiko Itoh, Akihide Kasai, Masashi Kiyota and Shingo Kimura

Quantitative evaluation of ecosystem services supporting the growth of Japanese chum salmon

4th CLIOTOP symposium, 15-19 October, 2018, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan

Karasawa Y, Ueno H, Tanisugi R, Yoon S, Kasai A and Kiyota M


日本系サケの成長を通じた生態系サービスの定量的評価

2018年度水産海洋学会研究発表大会,2018年11月16日~18日,東京大学大気海洋研究所

柄沢有香・上野洋路・谷杉諒・尹錫鎭・笠井亮秀・清田雅史

環境DNAによるニホンウナギの分布域の推定

2018年度水産海洋学会研究発表大会,2018年11月16日~18日,東京大学大気海洋研究所

笠井亮秀・定行洋亮・高田真悟・安孝珍・山崎彩・久米学・寺島佑樹・東信行・亀山哲・木村伸吾・山中裕樹 ・益田玲爾・山下洋


水温と塩分がニホンウナギの環境DNA放出量に及ぼす影響

2018年度水産海洋学会研究発表大会,2018年11月16日~18日,東京大学大気海洋研究所

高田真悟・高橋さやか・益田玲爾・笠井亮秀

環境DNA濃度の定量データと流動モデルの統合による個体数・生物量の推定

第1回環境DNA学会東京大会,2018年9月29日~30日,日本科学未来館

深谷肇一・村上弘章・尹錫鎭・南憲吏・長田穣・山本哲史・益田玲爾・笠井亮秀・宮下和士・源利文・近藤倫生


Evaluation of the fish distribution and their environmental DNA in a semi-closed bay

using a three-dimensional tracer model

第1回環境DNA学会東京大会,2018年9月29日~30日,日本科学未来館

Seokjin Yoon・笠井亮秀・村上弘章・南憲吏・益田玲爾・宮下和士・源利文・近藤倫生


Nutrients, chlorophyll and suspended solids from three rivers into Hakodate Bay, Hokkaido, Japan

ECSA 57, 3-6 September 2018, Pan Pacific Perth, Australia

A. Kasai, R. Sugimoto, N. Itoh, K. Tsukagawa, and K. Todate